通过网络药理学和生物信息学鉴定苦参碱联合甘草酸治疗肝细胞癌的机制分析。
摘要来源:Oxid Med Cell Longev。 2022;2022:2663758。 Epub 2022 年 9 月 19 日。PMID:36193082
摘要作者:韩涛、刘一鸣、陈雨桐、陈廷松、李一凡、李秋华、赵明芳
文章来源:韩涛
摘要:苦参碱和甘草甜素是临床应用的中药代表性活性成分。研究证明苦参碱具有抗肿瘤药理作用,甘草甜素具有保护肝功能的作用。然而,潜在的生物活性化合物和机制这些药物以及它们在杀死癌细胞和保护肝细胞方面是否具有协同作用仍不清楚。为了探讨苦参碱联合甘草甜素治疗肝细胞癌(HCC)的协同作用和机制,我们采用网络药理学和生物信息学分析。首先,从PubChem数据库中获取苦参碱和甘草甜素的化学基因相互作用信息。 HCC 的致病基因是从五个公共数据库中获取的。 HCC患者的RNA测序数据和临床信息从癌症基因组图谱(TCGA)下载。接下来,利用生物信息学分析确定苦参碱和甘草酸的潜在靶点与HCC相关靶点之间的重叠基因。我们构建了药物-靶标相互作用网络。通过单变量Cox回归模型和Lasso-Cox回归模型获得预后相关基因。结果经国际罐头协会验证cer 基因组联盟 (ICGC) 数据库。最后,我们预测了样本的免疫功能。药物-靶点相互作用网络由 10 个苦参碱和甘草甜素靶点组成。我们选择了由 3 个差异表达基因 (DEG) 组成的 Lasso-Cox 回归模型来预测该组合在 HCC 中的疗效。随后,我们利用构建的预后模型成功预测了 HCC 患者的总生存期,并研究了免疫反应的相关性。苦参碱和甘草甜素对HCC有协同作用。通过Lasso-Cox回归分析,我们获得的模型由三个药物靶基因组成。该模型独立预测了苦参碱和甘草甜素联合对HCC治疗和OS的影响,有助于指导临床治疗。该预后模型与患者的免疫细胞和免疫检查点相关,对HCC免疫治疗有辅助作用。苦参碱和甘草酸可以有治疗作用通过促进药物网络中核心基因的产生或增强其活性,提高患者的免疫系统功能,对HCC产生治疗作用。