对照组和结直肠癌患者在腺瘤中的人类肠道菌群的比较:末端限制片段长度长度多态性和下一代测序分析。
摘要来源:
oncolRep。EncolRep。20152015年11月4日。 href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26549775">26549775
Abstract Author(s):Chika Kasai, Kazushi Sugimoto, Isao Moritani, Junichiro Tanaka, Yumi Oya, Hidekazu Inoue,Masahiko Tameda,Katsuya Shiraki,Masaaki Ito,Yoshiyuki Takei,Kojiro Takase
文章隶属关系:chika kasai
摘要:结直肠癌(CRC)是日本癌症造成的癌症死亡的第三主要原因。 CRC的病因与许多因素有关,包括遗传突变,饮食,生活方式,炎症,以及最近的肠道微生物群。但是,与CRC相关的肠道菌群仍然在很大程度上尚未进行。这项研究使用了终端限制片段长度多态性(T-RFLP)和下一代测序(NGS)分析和比较日本对照受试者的肠道菌群和腺瘤中日本癌患者的肠道菌群。在结肠镜检查前,从49名对照组,50例结肠癌患者和9例结肠直肠癌患者(3/9例侵入性癌和6/9例)中收集了粪便样品;从每个粪便样品中提取DNA。根据T-RFLP分析,选择了12名受试者(腺瘤受试者中的6例对照和六个癌)。它们的样品用于NG和物种级分析。 T-RFLP分析显示,对照,腺瘤和癌组之间细菌种群没有显着差异。然而,NG显示腺瘤受试者中的对照和癌具有不同的肠菌群组成,ii),一个细菌属(Slackia)与对照组和四个细菌属(放线菌,肥大,肥大,富司杆菌,fusobacterium和Heamophilulu)显着相关。s) were significantly associated with the carcinoma-in-adenoma group, and iii), several bacterial species were significantly associated with each type (control: Eubacterium coprostanoligens; carcinoma in adenoma: Actinomyces odontolyticus, Bacteroides fragiles, Clostridium nexile, Fusobacterium varium, Haemophilus parainfluenzae, Prevotella stercorea, Gordonii链球菌和Veillonella dispar)。肠道微生物特性在对照组和腺瘤癌患者中不同,这表明肠道微生物群与CRC预防和发育有关。