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PLOS ONE。 2022; 17(7):E0268156。 EPUB 2022 7月28日。PMID: 35901082 Nasiri Khalili,Mohammad Sabzian-Molaei,Hosein Shahsavarani,Alireza Fattah Pour,Ahmad Molaei Rad,Amin Hadi

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fatemeh sabzian-sabzian-sabzian-Molaei

摘要

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尽管使用有效的药物和疫苗率,但在使用有效的药物和疫苗的范围中,冠状病毒突变,具有有效抑制活性对这种感染的药物的开发至关重要。 SARS-COV-2 EN通过将尖峰的受体结合结构域(RBD)连接到血管紧张素转换酶-2(ACE2)来构成细胞。根据先前的研究,天然肽静脉凝集素(UDA)对SARS-COV表现出抗病毒作用,但其机制尚未得到精确阐明。在这里,我们研究了SARS-COV-2的尖峰蛋白的UDA和RBD之间的相互作用。因此,使用ClusPro 2.0进行RBD-UDA的蛋白质蛋白对接。为了进一步确认复合物的稳定性,使用分子动态模拟(通过GROMACS 2020.2)研究了具有较高结合亲和力的RBD-UDA对接配合物,MM-PBSA计算了系统的结合自由能。此外,使用ELISA测定法检查UDA与RBD蛋白的结合。将结果与康复血清IgG的RBD结合样品的ELISA(来自从Covid 19恢复的供体)进行了比较。最后,使用MTT分析评估UDA的毒性。对接结果显示UDA与RBD Bindin结合G网站。 MD模拟说明了100 ns模拟期间UDA -RBD复合物是稳定的,平均结合能的计算为-47.505 kJ/mol。 ELISA和MTT的结果表明,UDA与IgG-RBD结合与RBD结合,在人类细胞中可能是安全的。此处提供的数据表明与S蛋白的UDA相互作用抑制了RBD的结合位点,它可以防止病毒附着于ACE2并进入宿主细胞。


重点研究课题

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