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摘要来源:
分子。 2022年10月28日; 27(21)。 EPUB 2022 10月28日。PMID: 36364158 Kapusta, Natalia Sizochenko, Kostyantyn M Sukhyy, Wojciech Kolodziejczyk, Glake A Hill, Julia Saloni
Article Affiliation:Olha Ovchynnykova
Abstract:The rapid spread of SARS-CoV-2 required immediate actions to control the transmission of the virus and minimize its impact on人类。该病毒基因组的广泛突变率有助于病毒快速适应环境变化的能力s,影响传播性和抗原性,并可能有助于免疫逃脱。因此,在疫苗开发和药物设计中工作的研究人员非常感兴趣,以考虑突变对病毒 - 药物相互作用的影响。在这里,我们提出了一条多坐菌药物发现管道,用于鉴定潜在的候选药物,该药物可以有效地抑制来自SARS-COV-2不同变体的峰值糖蛋白的受体结合结构域(RBD)。使用参考晶体结构创建并验证了八个用于选定变体的RBD的同源模型。然后,我们研究了SARS-COV-2的九种变体的宿主受体ACE2和RBD之间的相互作用。这使我们得出结论,有效的多变量靶向药物应能够阻止RBD中的残基Q(R)493和N487。使用分子对接,分子力学和分子动力学的方法,我们鉴定SARS-COV-2抑制。这些化合物是在柑橘类水果中发现的黄酮糖苷,这是传统中药的活跃成分。开发的管道可以进一步用于(1)尚不可用的晶体结构的模型突变体,并且(2)扫描更广泛的化合物库针对其他突变的病毒蛋白。