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Abstract Title:An Analysis Based on Molecular Docking and Molecular Dynamics Simulation Study of Bromelain as抗SARS-COV-2变体。
摘要来源：
前药。 2021; 12：717757。 EPUB 2021 8月20日。PMID： 34489706 34489706 Afriza Yelnetty, Rinaldi Idroes, Diah Kusumawaty, Talha Bin Emran, Talha Zahid Yesiloglu, Wolfgang Sippl, Shafi Mahmud, Taha Alqahtani, Ali M Alqahtani, Saeed Asiri, Mohammed Rahmatullah, Rownak Jahan, Md Arif Khan, Ismail celik
文章隶属关系：trina ekawati tallei
摘要：新型冠状病毒的快速传播被称为SARS-COV-2t。但是，尚未批准任何药物来治疗COVID-19。此外，该病毒尖峰蛋白上的受体结合结构域（RBD）以及该病毒的其他几个重要部分最近发生了突变，从而导致了新的病毒变体。尽管目前尚无治疗，但具有已知抗病毒特性的自然衍生分子可以用作潜在的治疗方法。 Bromelain是在菠萝的果实和茎中发现的一种酶。该物质已被证明具有广泛的抗病毒活性。在本文中，我们通过使用分子对接酶2（HACE2）靶向这种病毒相互作用的溴结合在这种病毒相互作用的侧面靶向溴链蛋白酶在这种病毒相互作用的侧面来抵消SARS-COV-2的各种变体的能力。我们成功地使用蛋白质建模对各种RBD变体进行了三维配置。 Bromelain对各种变体表现出良好的结合亲和力rbds的结合在RBD和HACE2之间的结合位点。该结果也显示在Bromelain，RBD和HACE2之间的建模中。分子动力学（MD）仿真研究显示，溴链蛋白酶和RBD蛋白的显着稳定性分别高达100 ns，RMSD值为2Å。此外，尽管RMSD增加和复合物的ROG值的变化，这可能是由于Bromelain和RBD蛋白之间的某些不稳定的相互作用，但每个复合物中的两种蛋白质保持键合，并且两种蛋白质结合的位点保持不变。这一发现表明，溴链蛋白酶可能对不同的SARS-COV-2变体产生抑制作用，为新的SARS-COV-2抑制剂药物铺平了道路。但是，需要对这种潜在的作用机理进行Moreandresearch。