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Abstract Title:RHAMNETIN IS A BETTER INHIBITOR OF SARS-COV-2 2-O-METHYLTRANSFERASE THAN DoluteGravir：一个计算预测。
摘要来源：
afr j Infect dis。 2022; 16（2）：80-96。 EPUB 2022 5月6日。PMID： 355582066“> 35582066 Olukemi A Onuh，Nkoli Wemeter，Doofan Bur，Oluwaseun A Obidei，Oluyomi Cornelius Dayisi，Jude N Akpa，Lovelyn Birah，Edward E Omaka，Frances Otibhor Iseghohi，Akinbobola Peace otitoto otito otito otito otito otito otip f uzor，jude nnaeek
背景： 2-o-甲基转移酶是2-o-甲基转移酶是造成SARS-COV-2 mRNA的上限，从而逃避了HOSTS免疫系统。 This study aims at identifying prospective natural inhibitors of the active site of SARS-CoV-2 2O-methyltransferase (2-OMT) through an in silico approach.
MATERIALS AND METHODS: The target was docked against a library of natural compounds obtained from edible African plants using PyRx - virtual screening 软件。抗病毒剂DoluteGravir的结合亲和力得分为-8.5 kcal molwith SARS-COV-2 2-OMT用作标准。使用其分子描述符通过Swissadme Web服务器筛选化合物以获取生物利用度。分别使用PKCSM和Molinspiration Web服务器进行了药代动力学特性和生物活性的筛选。 PLIP和FPOCKETS网络服务器用于绑定站点分析。 Galaxy Web服务器用于模拟目标的apo和Holo形式的时间分辨运动，而MDWEB Web服务器用于AN轨迹数据的外形。
结果： 由rhamnetin诱导的root-mean-square-deviation（rmsd）是1.656Acompareed to dolutegravir（1.5799a）。 Rhamnetin诱导的平均B因子为113.75，而DoluteGravir为78.87； Rhamnetin的根平方 - 裂缝（RMSF）为0.75，DoluteGravir为0.67。同样，在活跃部位，鼠李糖蛋白的结合亲和力得分为-9.5 kcal moland与dolutegravir相比，具有-8.5 kcal moland形成4氢键。
“ substract_label”> rhamn> rhamn> rhamn> dolutegravir。