通过对接和分子动力学模拟研究雄摩糖与人类SARS-COV-2尖峰受体结合结构域的结合亲和力。
摘要来源:
j biomol struct dyn。 2023年2月10日:1-16。 EPUB 2023 FEB10。PMID: 36764825 36764825 Priyadharshini,Isaac Arnold Emerson
文章隶属关系:Anil Bhattarai
摘要:SARS-COV-2是一种阳性的单链RNA病毒,会导致人类的致命性冠状病毒病(COVID-19)。人类SARS-COV-2的感染涉及含有受体结合结构域(RBD)的病毒表面峰值糖蛋白。 SARS-COV-2与宿主血管紧张素转换酶2(ACE2)受体的相互作用是由RBD介导的。它与宿主ACE2结合并影响病毒复制和疾病发病机理。因此,将RBD定为防止SARS-COV-2感染至关重要。在这项研究中,我们使用对接和分子动力学模拟来理解雄摩酰胺对SARS-COV-2尖峰蛋白的结合效应。在对接过程中,在配体和靶受体蛋白之间观察到强大的结合亲和力。 MD结果表明,与结合形式相比,无配体蛋白的构象波动更高。活性位点中的几个残基使S蛋白与配体相互作用进行构象重排。而RBD经历了构象转变,从而在与配体结合后获得了更大的稳定性。通过几种非共价相互作用来增强这种结合,这些相互作用使复杂结构具有更高的结合亲和力。该研究的总体发现可能会提供一些有关在Covid-19预防策略中的潜在治疗剂发展的宝贵见解。