Qatar Med J. 2021; 2021（1）：12。 EPUB 2021 3月12日。PMID： 34604010 Althani，Hadi M Yassine
文章隶属关系：Shilu Mathew Mathew
摘要：新型严重的急性急性呼吸综合症冠状病毒2（SARS-COV-2）是唯一达到大流行阶段的人畜共患病cov，既不到达有效的疫苗，也没有特定的特定治疗。尖峰糖蛋白具有介导Viruss进入宿主细胞的受体结合结构域（RBD）。这项研究的目的ED通过化学和天然化合物的计算筛选来鉴定针对尖峰蛋白RBD结构域的新型抑制剂。峰值蛋白是根据最近报道的电子显微镜蛋白结构（PDB ID：6VSB）和先前描述的SARS-COV蛋白结构（PDB ID：6ACD和6ACJ）建模的。虚拟实验室基准CLC药物发现用于计算筛查当前处方药（n = 22），天然抗病毒药（n = 100）和天然化合物（n = 35032）的潜在抑制作用。还进行了定量结构活性关系（QSAR）研究，以确定以抗病毒活性而闻名的主要粘合剂。目前用于治疗SARS-COV2，羟基氯喹啉和favipiravir的药物中，具有四个H键的最佳粘合剂，并具有四个H键的最佳粘合剂，并具有-6.66 kC/36.66 kC/sal/a的平均值。在评估抗病毒化合物时，fosamprenavirAbacavir显示出五个H键的有效结合，平均结合亲和力为-18.75 kcal.moland的最小相互作用能为-3.57 kcal/mol。此外，对100种天然抗病毒化合物的筛选预测了甘氨酸，Nepritin，Nepritin，Punicalagin，epigallocatechin Gallate和theaflavin的潜在结合模式（-49.88 kcal/mol的平均结合亲和力（平均结合亲和力）和-4.35 kcal/mol的最低相互作用能量。此外，该研究报告了25种天然化合物的列表，这些化合物表现出有效结合，其平均结合亲和力为-51.46 kcal/mol。使用计算筛选，我们确定了与RBD区域结合的潜在SARS-COV-2 S糖蛋白抑制剂。使用基于结构的设计和基于组合的药物疗法，可以使用该鉴定的分子来产生抗SARS-COV-2候选药物。