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Abstract Title:

Fisetin 8-C-glucoside as entry inhibitor in SARS CoV-2 infection: molecular建模研究。

摘要来源:

j j Biomol struct dyn。 2020年12月31日:1-10。 EPUB 2020 12月31日。PMID: 333382023“> 333382023 隶属关系:

abha mishra

摘要:

冠状病毒是感染包括人类在内的各种物种的RNA病毒。 TMPRSS2是SARS COV-2进入主机单元的网关。它导致峰值蛋白质的蛋白水解活化并将肽的排放量排入宿主细胞。 TMPRSS2抑制可能是阻止病毒进入的方法之一,因此,在目前的螺柱中已经探索了Fisetin和TMPRSS2的相互作用模式和结合能y。 TMPRSS2肽用于同源建模,然后进行进一步研究。 Fisetin的分子对接评分和MMGBSA结合能比Nafamostat(已知的TMPRSS2抑制剂)更好。 fisetin和nafamostat的后对接MM -GBSA自由能分别为-42.78和-21.11 kcal/mol。 Fisetin与Val 25,His 41,Lys 42,Lys 45,Glu 44,Ser186形成H键。 Nafamostat与Lys 85,ASP 90,ASP 203形成了H键。TMPRSS2,TMPRSS2-五酯素的RMSD图和TMPRSS2-NAFAMOSTAT复合物在150 NS的整个模拟过程中显示出非常小的波动,显示出稳定的轮廓。在RMSF研究中,TMPRSS2-Fisetin和TMPRSS2-Nafamostat复合物波动的显着降低发生在他的41,GLU 44,Glu 136,Ser 186左右。在仿真过程中,与残基Val 25,他的41,GLU 44,LYS 45,LYS 87,GLY 136,GLN 183,SER 186同样,Nafamostat的相互作用同样,nafamostat与Lys 85,ASP 90,ASN 163,ASN 163,ASP 203和Ser Ser Ser Ser 205和Ser Ser Ser Ser 205。TMPRSS2分别为-51.87±4.3和-48.23±4.39 kcal/mol,分别为fisetin和nafamostat。由Ramaswamy H. Sarma传达。

研究类型 : 体外研究
更多链接
疾病 : 冠状病毒感染,
治疗物质 : 漆黄素,

重点研究课题

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