单击此处阅读完整的文章。 摘要标题：
dieckol及其衍生效应，并在范围VUI 202012/01）：一项计算研究。
摘要来源：
MAR药物。 2021年4月25日； 19（5）。 EPUB 2021 4月25日。PMID： 33922914> 33922914 Abdulrahman Alsultan，Adil Alshoaibi，Bachir Yahia Khelif
文章隶属关系：Mohammad aatif
摘要：与SARS-COV-2相关的发病率和死亡率的高风险已加速了许多潜在疫苗的发展。但是，这些疫苗是针对中国武汉分离的SARS-COV-2设计的，因此可能对其他SARS-COV-2变体（例如英国变体）（VUI-202012/01）有效。英国SARS-COV-2变体在峰值蛋白中具有D614G突变，从而赋予其高感染率。因此，必须采取更新的策略来设计针对SARS-COV-2突变形式的专门设计的新型疫苗和候选药物。一种这样的策略是靶向ACE2（血管紧张素转换酶2） - 蜘蛛蛋白RBD（受体结合结构域）相互作用。在这里，我们生成了SARS-COV-2 UK菌株的尖峰蛋白RBD的同源模型，并采用了采用不同计算方法的海藻数据库进行筛选。根据高通量虚拟筛选，标准精度和额外的精度分子对接，我们将BE011（Dieckol）确定为针对RBD的最有效的化合物。然而，二家未显示类似药物的特性，因此在硅中产生了不同的衍生物，并评估了结合潜力和类似药物样的特性。一个Dieckol衍生物（DK07）对RBD表现出良好的结合亲和力以及可接受的物理化学，药代动力学，类似药物和药用特性。对RBD-DK07相互作用的分析表明，与介导ACE2-RBD相互作用的关键残基形成了氢键，静电相互作用以及疏水相互作用。分子动力学模拟证实了RBD-DK07复合物的稳定性。自由能计算表明，静电和范德华相互作用在稳定RBD-DK07复合物中的主要作用。因此，DK07可以作为RBD-ACE2相互作用的潜在抑制剂发展。但是，这些结果需要通过体外和体内研究进一步验证。