红茶生物活性剂作为SARS-COV-2(3ClPro,PLPRO和RDRP)多个靶标的抑制剂:虚拟筛选和分子动态仿真研究。
摘要来源:
j j j biomol结构dyn。 2021年3月10日:1-24。 EPUB 2021 3月10日PMID: 33715595 Borkotoky,Sangeeta Borchetia,Pritom Chowdhury,Saurov Mahanta,Anoop Kumar Barooah
文章隶属关系:Madhurjya Gogoi
摘要:摘要:
由于新颖的严重急性急症综合症Corona Virus 2(Sars-Cov-2(Sars-Cov-2),全球性pandecialdion造成了全球性大流行。缺乏针对这种高度传染性病毒的明确疫苗/药物,已经加快了有关新型天然和合成抑制剂的探索性研究。茶是生物活性剂的丰富来源,已知具有抗病毒特性。在这项研究中,涉及ADMET性质筛选,受体 - 叶子的抗肌电学使用对接和分子动力学(MD)模拟,以筛选SARS-COV-2的三个选定靶标(RDRP,3CLPRO和PLPRO)的潜在茶生物活性抑制剂。 Among the 70 tea bioactives screened, theaflavin 3,3-di-gallate (TF3), Procyanidin B2 and Theaflavin 3-gallate (TF2a) exhibited highest binding affinities towards RdRp, 3CLpro/Mpro and PLpro targets of SARS-CoV-2 with low docking scores of -14.92, -11.68 and -10.90 kcal/mol, 分别。所有这些都显示出大量的氢键以及活性位点和周围的其他相互作用。有趣的是,与已知的抗病毒药物相比,我们研究中的顶级生物活性剂显示出更高的结合亲和力。此外,当对100纳秒进行MD模拟时,在结合过程中,顶部蛋白质配体复合物在结合过程中显示出较小的构象变化。 MMPBSA结果表明,RDRP-TF3,3clpro----------和Plpro-TF2A复合物稳定,结合自由能为-93.59±43.97,-139.78±16.51和-96.88±25.39 kJ/mol。我们的结果表明,在红茶中发现的曲夫蛋白3,3-二元,theaflavin 3-gallate和procyanidin b2具有作为SARS-COV-2选定靶标的抑制剂的潜力,可以被视为对未来对COVID-19的未来研究中的药物候选者。
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