泰迪研究的早发1型糖尿病中的人类肠道微生物组。
摘要来源：
自然。 2018年10月； 562（7728）：589-594。 EPUB 2018年10月24日。PMID： 30356183 30356183 Schwager，Surya Tripathi，Timothy D Arthur，Kendra Vehik，ÅkeLernmark，William a Hagopian，Marian J Rewers，Jin-Xiong She，Jorma Toppari，Anette-G Ziegler，Anette-G Ziegler，Anetter-G Ziegler，Beana Akolkar，Beata Akolkar，Jeffrey P Krischer，Jeffrey P Dirosopher J diroser J stewart Jose Jose Jose josine jjamim jjami jami jami， Gevers, Harri Lähdesmäki, Hera Vlamakis, Curtis Huttenhower, Ramnik J Xavier
Article Affiliation:Tommi Vatanen
Abstract:Type 1 diabetes (T1D) is an autoimmune disease that targets pancreatic islet beta cells and incorporates genetic and environmental factors, including complex genetic elements, patient暴露和肠道微生物组。病毒感染和更广泛的肠道dysbioSeshave被确定为潜在原因或促成因素；但是，人类研究尚未确定可预测自身免疫性或T1D的微生物组成或功能触发器。在这里，我们分析了来自783个主要是白人，非西班牙裔儿童的粪便样品中的10,913个宏基因组。每月从三个月大的年龄到糖尿病的环境决定因素（Teddy）研究的临床终点（胰岛自动免疫或T1D）每月收集样品，以表征早期肠道肠道微生物组的自然历史，这些历史与胰岛自身免疫性，T1D诊断，诸如Antstosics和其他常见的早期生活事件以及其他常见的早期生活事件以及其他常见的早期生活和替代品有关。对照儿童的微生物组包含更多与发酵和短链脂肪酸的生物合成相关的基因，但是这些基因并不始终与地理上不同临床中心的特定分类单元相关，这表明微生物相关因素相关。T1D在分类学上是扩散的，但功能更连贯。当我们调查婴儿微生物组的更广泛的建立和发展时，分类学和功能谱都是动态的，并且高度个性化，并且在生命的第一年中，由三种主要的双歧杆菌种类（B. bifidum，B。B. b. breve或b. longum或b. longum B. b. b. b. longum）或属protylum proteybocteria占据主导地位。特别是，在母乳喂养的婴儿中特别存在基因在长长芽孢杆菌子集中利用人乳寡糖的菌株特异性运输。据我们所知，这些对泰迪肠道宏基因组的分析为我们所知，是发展中肠道微生物组的最大，最详细的纵向功能特征，与胰岛自身免疫，T1D和其他幼儿事件有关。这些数据与人类群体的现有证据和T1D小鼠模型一起，支持短链脂肪酸在早期发作的人类T1D中的保护作用。