丙型肝炎病毒NS3/4A抑制和单宁的宿主免疫调节:
摘要来源:
分子。 2022年2月5日; 27(3)。 EPUB 2022 2月5日。PMID: 35164341 35164341 Umashankar Vetrivel,Subarna Roy,Sanjay H Deshpande,Harsha v Hegde
文章隶属关系:Vishal S Patil
摘要:retz。构成了传统民间医学的关键组成部分,还据报道具有抗肝炎病毒(HCV)和免疫调节活动。然而,有关该植物与HCV和人类蛋白质的植物化学物质之间分子间相互作用的信息尚未建立。因此,通过这项当前的研究,我们研究了涉及网络药理学和结构性的硅策略中的HCV NS3/4A抑制性和宿主免疫调节活性生物信息学技术。首先,从生物数据库和已发表的文献中策划的植物化学数据集。此外,使用BindingDB对HCV NS3/4A和免疫系统中涉及的其他可能的宿主目标预测了植物复合的靶向能力。此外,使用POAP管道执行的自动库克Vina将确定的目标停靠在植物化学数据集上。将所得的具有显着结合能的对接配合物进行50 ns分子动力学(MD)模拟,以推断复合物的稳定性。在网络药理学分析过程中,使用字符串和Reactome途径数据库进行了基因集途径富集宿主靶标。此外,使用Cytoscape 3.6.1构建化合物,蛋白质和途径之间的生物网络。此外,还可以使用Molsoft,Adverpred和预序方法。在41个选定的化合物中,预计10种靶向HCV NS3/4A,并且具有吸毒和无毒的特性。在这10个分子中,在Chebulagic Acid和1,2,3,4,6-戊酰葡萄糖中表现出有效的HCV NS3/4A抑制活性,因为这些活性得分为-8.6 kcal/mol/mol的最低结合能(BE),与11 kcal/mol具有11 kcal/mol,具有11 kcal/mol,具有11 kcal/mol,并具有11个与20个间相互作用的相互作用相互作用,分别是有效的。这些发现与Asunaprevir(已知的HCV NS3/4A的抑制剂)高度可比,该抑制剂的评分为-7.4 kcal/mol,具有20个关键分子间相互作用。 MD研究还强烈表明,Chebulagic Acid和1,2,3,4,6-戊酰葡萄糖是有前途的铅,因为这些分子在50 ns的生产运行过程中表现出稳定的结合。此外,对18种蛋白靶标的基因集富集和网络分析优先于10种化合物,并被预测可能调节宿主免疫系统,止血,细胞因子水平,白介素信号通路和血小板聚集。在总体分析上,本研究预测,单宁具有潜在的HCV NS3/4A抑制性和宿主免疫调节活性。但是,需要进一步的实验研究以确认效率。