( - )如何从绿茶中透露绿茶的epigallocatechin防止HIV-1感染?来自计算建模的机械见解及其对抗HIV-1进入抑制剂的合理设计的影响。
摘要来源:
j j Phys Chem B. 2006 Feb 16; 110(6):2910-7。 PMID: 16471901 HAMZA
摘要:可能预防人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)进入细胞的抑制剂被认为是希望的下一代抗HIV-1药物。高度可取的是,由于GP120-CD4结合是HIV-1进入细胞中HIV-1的初步步骤,因此与细胞的糖蛋白CD4的有效抑制剂阻断结合具有HIV-1的糖蛋白GP120。最近有报道说( - ) - 绿茶中的epigallocatechin Gallate(EGCG)是一种抑制剂阻止GP120-CD4结合。但是抑制机制仍然未知。为了了解抑制机制,已经在本研究中进行了广泛的分子对接,分子动力学模拟和结合自由能计算,以预测水中CD4-EGCG,GP120-CD4和GP120-CD4-EGCG的最有利的结构。结果表明,EGCG与CD4结合的方式使GP120与CD4-EGCG复合物的结合亲和力可忽略不计。因此,EGCG与CD4的有利结合可以有效阻断GP120-CD4结合。计算出的CD4-EGCG结合亲和力(deltag(bind)= -5.5 kcal/mol,k(d)= 94 microm)与可用的实验数据非常吻合,该数据表明IC(50)对于EGCG块CD4-GP120的结合,IC(50)大约100 microm。这些结果和见解为新颖,更有效的抑制剂的未来设计提供了合理的基础,以阻止GP120-CD4结合。