分子对接和动力学模拟分析,对Nigella sativa L.的胸腺醌和胸腺化合物进行了抑制p38蛋白质:肝细胞癌癌的可能补救措施。
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Med Chem。 2019年4月16日。epub 2019 4月16日。PMID: 31038073 31038073 31038073 ahmad
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背景: 目前正在应用针对p38的新颖拮抗剂,目前正在应用肝细胞癌。蛋白质 - 配体相互作用在识别发挥药理作用的可能机制中起着重要作用。 p38的参与仍然是抗癌药物发育的重要目标,因为它激活了诱导肝癌细胞凋亡的目的:目的是鉴定出最好的候选者。M与肝细胞癌(HCC)结合的植物通过计算方法靶向。
材料和方法: 报告了诸如胸腺素的含水症和thymoquinone prothy thymoquinone和thymoquinone的含量。 p38。使用ChemDraw Ultra 10软件制备了植物成分的结构,并将其转换为3D PDB结构,并使用Discovery Studio Client 2.5最小化。靶蛋白p38从RCSB PDB中检索。 Lipinskis rule and ADMET toxicity profiling were carried out on the phytoconstituents of the N. sativa, and the compounds were further promoted for molecular docking and MD simulation analysis.
RESULTS: The docking results revealed promising inhibitory potential of thymoquinone against与具有BI的已知标准阿霉素相比,结合能为-7.67 kcal/mole的p38分别为-6.68 kcal/mol。此外,进行了5NS的分子动力学(MD)模拟,以优化柔韧性p38稳定性。发现p38- thymquinone络合物非常稳定,RMSD值为0.2nm。
结论: 获得的结果提出的结果提出了与选择靶标的胸喹酮结合能。因此,这种化合物具有针对肝细胞癌的杰出潜力,必须对针对肝细胞癌进行实验性工作。