传染性疫苗衍生的红宝石病毒出现，持久和进化。 2019 10; 15（10）：E1008080。 EPUB 2019 10月28日。PMID： 31658304“> 31658304 Suppiah, Adebola Adebayo, Emily Abernathy, Morna Dorsey, Lionel Bercovitch, Kenneth Paris, Kevin P White, Alfons Krol, Julie Dhossche, Ivan Y Torshin, Natalie Saini, Leszek J Klimczak, Dmitry A Gordenin, Andrey Zharkikh, Stanley Plotkin, Kathleen E Sullivan，Joseph Icenogle
文章隶属关系：Ludmila Perelygina
摘要：Rubella病毒病毒（RV）与原发性免疫缺陷（PID）儿童的肉芽肿相关。在这里，我们报告了传染性免疫缺陷相关的疫苗衍生的风疹VI的恢复和表征四名患者诊断性皮肤活检的ruses（IVDRV）。通过将IVDRV的完整基因组序列与疫苗病毒RA27/3的基因组进行比较，研究了PID宿主内的序列演化。每个IVDRV的差异程度与持续时间的持续时间相关，表明持续的host内进化。同义和非同义替代的演变率估计分别为5.7 x 10-3 subs/site/年和8.9 x 10-4 sibs/site/Year。突变光谱和特征表明Apobec胞苷脱氨酶的主要作用，而ADAR腺苷脱氨酶在产生IVDRV的多样性中起了次要作用。 E1糖蛋白识别出可能处于阳性选择性压力的区域中氨基酸取代的基因和3D热点突变的分布。粒状瘤中的准特性多样性高于回收的感染性IVDRV。在WI-38纤维中评估了IVDRV的生长特性最后的文化。 IVDRV分离株均未显示为野生型表型的完全回归，但是IVDRV的复制和持久性特征与RA27/3疫苗菌株的复制和持久性特征不同，从而预测了IVDRV的传播性和致死性的预测。然而，在鼻咽标本中检测IVDRV RNA，以及来自接种疫苗的人血清对某些IVDRV菌株的中和不良的检测表明，IVDRV载体可能有公共卫生风险。在三分之二患者的血清中检测IgM抗体的IgM抗体可能是病毒持久性的标志物，对于在病变发育前鉴定患有IVDRV的患者可能有用。对持久性IVDRV的进化动力学的研究将有助于发展感染控制策略和抗病毒疗法。