3,751个镁结合位点已在人类蛋白质上检测到。
摘要来源：
BMC生物信息学。 2012; 13 Suppl 14：S10。 EPUB 2012年9月7日。PMID： 23095498
摘要作者：Damiano Piovesan，Giuseppe Profi，Pier Luigi Martelli，Rita Casadio
文章隶属关系：Biocomputing Group，Biocomputing Group，Biologna，Bologna，Bologna，Boologna，Boologna，Boologna，Boologna，Boologna，Boologna，Boologna，Boologna，Boologna，Boologna，Boologna，Brogna，Brogna，40126，Italy.40126，Italy。prouct。由于该离子在几个重要的生物学过程和相关的分子病原体中的相关性， 分子医学的镁研究正在增加。仍然很难从蛋白质共价结构中预测人链是否参与镁结合。这主要是由于蛋白质和蛋白质中镁结合位点的结构特征的信息很少n络合物。镁结合特征与其他二价阳离子（如钙和锌）不同。在这里，我们解决了一个与蛋白质注释相关的问题：有多少人蛋白可以结合Mg2+？我们的分析是利用最近实现的博洛尼亚注释资源（BAR-PLUS）进行的，这是一种非等级聚类方法，依赖于对同进的序列比较，将大约1400万种蛋白质从300.000种物种及其分组中分组为clusters及其分组到统计验证后可以安全继承。 在最新版本的人蛋白质组的群集分配后，我们可以为其分配假定的MG结合位点的人类蛋白质总数为3,751。在这些蛋白质中，有2,688个直接从人类模板上继承注释，而1,063个继承了其他生物模板的注释。蛋白质结构高度缺点在给定的群集内部。在给定序列与基于隐藏的马尔可夫模型（HMM）程序获得的给定簇的蛋白质结构对齐后，结构特性的转移是可能的。 Interestingly a set of 370 human sequences inherit Mg2+ binding sites from templates sharing less than 30% sequence identity with the template.
CONCLUSION: We describe and deliver the"human magnesome", a set of proteins of the human proteome that inherit putative binding of magnesium ions.使用我们的BAR-HMG，包括1,341个与387个序列相对应的镁结合蛋白结构在内的251个簇足以注释3,751个人类序列中的约13,689个残基，为“镁结合”。因此，蛋白质结构充当人类序列的结构和功能注释的三维种子。数据库专门收集所有可以注释的人类蛋白将我们的程序作为“镁结合”，相应的结构和bar+簇从那里得出注释（http://bar.biocomp.unibo.it/mg）。