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从C57BL/6J小鼠基因组中识别一组Mus Dunni内源性病毒样性内源性逆转录病毒:前病毒基因组,菌株分布,表达特征和基因组整合谱。

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chalomosomemosomemosomemosomemosomemosomemosomemosomes。 2012年11月30日。epub 2012年11月30日。pmid:摘要作者:

kang-hoon lee,ri-na You,David G Greenhalgh,Kiho Cho

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加利福尼亚大学,戴维斯大学和Shriners Hospitals for Shriners Hospitals for North Californa north Califortia,2425 Stockton Blvd.通过与内源性逆转录病毒(ERV)相关的序列。但是,尚未建立鼠标ERV和相关元素的全面概况。在这项研究中,我们鉴定了一组来自小鼠基因组的ERV,并表征了EIR生物学。使用自定义ERV挖掘方案,在C57BL/6J小鼠基因组上映射了191 ERV(以前报道的159个基因座和32个新基因座),暂定命名为Mus Dunni内源性病毒(MDL-servs)(MDL-Servs)。其中七个保留了三个逆转录病毒多肽(GAG,POL和ENV)的假定完全编码潜力。在检查的57种小鼠菌株中,除Mus Pahari/EI菌株以外的所有小鼠菌株的PCR扩增子都对应于保守的MDL-VER区域。有趣的是,Mus Caroli/eijs扩增子比其他扩增子大一些,与M. caroli/eij/eij和C57BL/6J菌株的MDL-Serv群体之间的系统发育距离相吻合。与大脑,心脏,肾脏和肝脏相比,在C57BL/6J小鼠的肺,脾脏和胸腺中高表达MDL-ers。在六个注释基因的内含子中映射了七个MDL-serv。有趣的是,一些MDL-ders在染色体X中定期映射在三个簇上。形成串联阵列的镶嵌式镶嵌单元的几种恢复元素之一,表明马赛克重复单元的形成之前是串联布置事件。有必要进行进一步的研究,以了解MDL-Serv在正常和病理状况下的生物学作用。


重点研究课题

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