青藤碱通过抑制MMP9和炎症细胞因子表达治疗类风湿性关节炎：生物信息学分析与实验验证。
摘要来源：《科学报告》2024 年 6 月 4 日；14(1):12786。 Epub 2024 年 6 月 4 日。PMID：38834626
摘要作者：罗金芳、朱毅、于阳、陈玉杰、何康、刘建新
文章单位：罗金芳
摘要：类风湿性关节炎（RA）是一种以炎性细胞浸润和关节损伤为特征的慢性全身性自身免疫性疾病。中国政府已批准处方药青藤碱（SIN），一种有效的抗炎药物，用于治疗类风湿性关节炎。本研究基于生物评估评估了 SIN 在 RA 中可能的抗炎作用信息学分析和实验。从基因表达综合（GEO）数据库中获取了六个微阵列数据集。我们使用 R 软件来识别差异表达基因 (DEG) 并进行功能评估。使用 CIBERSORT 计算 22 个浸润免疫细胞的丰度。加权基因共表达网络分析 (WGCNA) 用于发现与 M1 巨噬细胞相关的基因。使用四个公共数据集来预测 SIN 的基因。随后，对 hub 基因进行功能富集分析。采用 cytoHubba 和最小绝对收缩和选择算子（LASSO）来选择中心基因，并使用接受者算子特征（ROC）曲线预测其诊断效果。进行分子对接以确认 SIN 和 hub 基因之间的亲和力。此外，使用蛋白质印迹和酶联免疫在 LPS 诱导的 RAW264.7 细胞系中验证了 SIN 的治疗功效轨道测定法（ELISA）。基质金属蛋白酶9（MMP9）使用生物信息学分析和分子对接确定为RA中的HUB M1巨噬细胞相关生物标志物。我们的研究表明，MMP9参加了IL-17和TNF信号通路。此外，我们发现SIN抑制MMP9蛋白过表达和促炎性细胞因子，包括LPS诱导的RAW264.7细胞系中的肿瘤坏死因子-α（TNF-α）和白介素6（IL-6）。总之，我们的工作为RA的病理生理提供了新的启示，并将MMP9鉴定为可能的RA关键基因。总之，以上发现表明，从新兴的研究角度来看，罪可能是治疗RA的潜在具有成本效益的抗炎药。