尿石素 A 作为治疗脊髓损伤的潜在药物:利用网络药理学的机制研究方法。
摘要来源:Evid Based Complement Alternat Med。 2022;2022:9090113。 Epub 2022 年 4 月 22 日。PMID:35497925
摘要作者:毛超、栾浩鹏、高树涛、盛伟斌
文章单位:毛超
摘要:目标:这项研究的重点是检查潜在目标、行动网络和利用网络药理学 (NP) 研究尿石素 A (UA) 在脊髓损伤 (SCI) 治疗中的作用机制。
方法: 我们使用了 SwissTargetPrediction、PharmMapper、TargetNet数据库获取UA行动目标。我们检索了 OMIM、GeneCards、CTD 和 DrugBank 数据库来筛选 SCI 治疗的选定靶基因。通过构建维恩图获得了 UA 和 SCI 数据库之间靶基因的交集,从而确定了该疾病的常见药物靶点。利用Cytoscape 3.7.2构建靶点关系网络,利用STRING平台分析蛋白质相互作用网络。蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络可以建立在STRING数据库上。使用DAVID 6.8数据库完成目标交叉点的基因本体(GO)功能和KEGG通路分析。我们为 UA-SCI 交互的行动构建了初步的网络目标。利用AutoDock软件,我们检测了UA与其靶蛋白之间的分子对接相互作用,进一步验证了UA的作用机制。
结果:我们获得了 318 个 UA 药物靶点和 1492 个 SCI 疾病靶点。我们总共鉴定了 118 个常见的 UA-SCI 靶点。基于 PPI 分析,我们鉴定了 MAPK1、SRC、AKT1、富集分析显示 HRAS、MAPK8、HSP90AA1、MAPK14、JAK2、ESR1 和 NF-B1 是可能的治疗靶点。 PI3K-AKT、VEGF 和 TNF 信号通路对于 NP 分析至关重要。分子对接表明 UA 对对接蛋白具有很强的亲和力(结合能范围:-6.3 至 -9.3kcal mol)。
结论:我们采用 NP 方法来验证和预测潜在机制本研究的另一个目的是为进一步研究UA在SCI治疗中的潜力提供理论基础。