利用转录组分析系统了解黄芩苷抗胃癌机制。
摘要来源：Biomed Res国际。 2021；2021：5521058。 Epub 2021 年 7 月 19 日。PMID：34337018
摘要作者：周文曲、米高、梁春晓、林碧婷、吴庆华、陈瑞坤、熊晓晓、陈星、王世杰、吴丽婷、吴一玲、李海清、付欣、洪伟
文章所属单位：周文曲
摘要：背景：胃癌 (GC) 是最常见的癌症类型。它是高度恶性的，其特点是快速且不受控制的生长。在多种癌症中研究了黄芩苷的抗肿瘤活性。但其作用机制却是f 的作用尚未完全阐明。我们通过 RNA-seq 转录组分析系统地了解了黄芩苷抗 GC 的作用机制。
方法：将人GC细胞(SGC-7901)暴露于200μg/ml黄芩苷24小时。使用转录组 RNA-seq、基因本体论 (GO) 和京都基因和基因组百科全书 (KEGG) 富集分析来鉴定黄芩苷对 SGC-7901 细胞的体外抗肿瘤作用。构建了差异表达基因（DEG）的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。构建了竞争性内源 RNA (ceRNA) 网络，并在使用 qRT-PCR 验证后进行了进一步分析。
结果：总计68 个 lncRNA、20 个 miRNA 和 1648 个 mRNA 在黄芩苷处理的 SGC-7901 GC 细胞中差异表达。 ceRNA 调控网络中包含 3 个 lncRNA、6 个 miRNA 和 7 个 mRNA。GO分析显示主要DEG参与细胞周期和细胞死亡的生物过程。 KEGG通路分析进一步提示p53信号通路参与黄芩苷诱导的SGC-7901细胞抗肿瘤作用。 qPCR进一步证实黄芩苷对SGC-7901细胞具有抗肿瘤作用，这与测序数据结果一致。
结论：< /span>综上所述，黄芩苷抗GC的作用机制涉及多个靶点和信号通路。这些结果为黄芩苷的抗肿瘤机制提供了新的见解，有助于开发治疗GC的新策略。