乳腺癌免疫相关基因的筛选及芒柄花素免疫治疗效果的预测:生物信息学分析。
摘要来源:Evid Based Complement Alternat Med。 2022;2022:9942373。 Epub 2022 年 4 月 15 日。PMID:35463082
摘要作者:宋晓彤、李洁
文章所属单位:晓彤歌曲
摘要:目的:免疫疗法是一种有前途的乳腺癌治疗方法。尽管如此,肿瘤异质性和肿瘤微环境中免疫细胞之间的相互作用限制了其有效性。芒柄花素——从中药植物中提取——可以抑制肿瘤生长,诱导细胞凋亡和血管生成,逆转mu耐药性。然而,其对乳腺癌免疫细胞的功效和作用机制仍不清楚。在这里,我们筛选了乳腺癌的免疫相关基因,以确定芒柄花素作为治疗药物的潜力。
方法:GSE103512分别从GEO和ImmPort数据库获取GSE139038乳腺癌微阵列数据和免疫相关基因数据,分析差异表达的免疫相关基因(IRG)乳腺癌组织与正常乳腺组织相比。使用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,根据拓扑参数筛选差异表达的IRG。应用Kaplan-Meier检验检测与乳腺癌生存相关的差异表达IRG,并利用分子对接分析芒柄花素与差异表达IRG的相互作用。最后,迪之间的关系使用TIMER2.0数据库分析差异表达的IRG和乳腺癌免疫细胞浸润。
结果:共29个通过GEO和ImmPort数据库筛选乳腺癌差异表达IRG,并根据PPI网络拓扑参数筛选10个关键差异表达IRG。其中,CXCL12、ESR1、IGF1 和 FOS 与乳腺癌生存相关。此外,IGF1、ESR1 和 CXCL12 被发现对芒柄花素具有稳定的结合位点。这些基因与乳腺癌组织中大量免疫细胞浸润有关。
结论:综上所述,芒柄花素可能发挥抗肿瘤作用通过作用于 CXCL12、ESR1 和 IGF1,可能与免疫检查点抑制剂具有潜在的协同作用。