MDM2 是甘草酸的潜在靶基因规避乳腺癌对他莫昔芬的耐药性:综合生物信息学分析。
摘要来源:Asian Pac J Cancer Prev。 2022 年 7 月 1 日;23(7):2341-2350。 Epub 2022 年 7 月 1 日。PMID:35901340
摘要作者:Salma Nur Azizah Azzahra、Naufa Hanif、Adam Hermawan
文章归属:Salma Nur Azizah Azzahra
摘要:背景:他莫昔芬是首选药物用于治疗乳腺癌,特别是雌激素受体阳性的管腔 A 亚型。然而,他莫昔芬耐药性的增加凸显了开发一种药物以增强其有效效果的必要性。
目的:虽然已知甘草酸 (GA) 对密歇根癌症基金会表现出细胞毒性作用 - 7 细胞中,其用于克服他莫昔芬耐药性的具体基因靶点和途径尚不完全清楚。因此,本研究的目标是利用生物信息学方法发现GA的潜在靶点和通路。
方法:<使用来自 GSE67916 和 GSE85871 的微阵列数据在 Gene Expression Omnibus NCBI 数据库中鉴定了差异表达基因 (DEG)。使用 DAVID v6.8、STRING-DB v11.0 和 Cytoscape v3.8.0 对这些 DEG 进行了进一步分析。使用cBioPortal进行基因变异分析进行靶标验证,并通过分子对接方法检查相关相互作用过程。
结果: Gene Ontology 和京都基因与基因组百科全书通路富集分析确定 PI3K-AKT 信号传导为潜在的靶机制。蛋白质-蛋白质相互作用网络的构建和枢纽基因的分析确定了前 25 个枢纽基因。在六个潜在靶基因中观察到遗传改变,例如 CDK2、MDM2、NF1、SMAD3、PTPN11 和 CALM1。分子对接分析表明,GA的对接得分低于p53天然配体的对接得分。更重要的是,3n PI3K-AKT 信号通路是克服乳腺癌他莫昔芬耐药性的潜在靶点。
结论: MDM2 可能是 GA 的潜在基因靶标,PI3K-AKT 信号传导可能是克服乳腺癌细胞中他莫昔芬耐药性的潜在机制。需要进行更多研究来验证本研究的结果。